أن مشروع الأكاديمية هو مشروع إنساني تنويري يهدف الى تخريج باحث في العلوم الانسانية يتمكن من إجراء بحوث في اختصاصات متعددة. فبعد الاجتماعات الديرية قدم الاب يوسف توما فكرة انشاء جامعة شعبية على غرار ما يوجد في بعض البلدان الاوربية التي انشأت مراكز علمية تسمح لمن يريد ان يطور معارفه بالدراسة في حقل العلوم الانسانية من متخصصين او من لم تسمح له الظروف بالدراسة ان يجد في هذا المركز المكان الذي يقدم له فرصة التعرف بصورة اكاديمية على المواد الفلسفية والاجتماعية وعلم النفس واللغات.